阿古柏率領浩罕烏茲別克族軍隊相繼攻佔了喀什噶爾漢城、同治引發暴動。新疆知縣恩錦逃走，回乱控制了庫爾喀喇烏蘇（今烏蘇市）以東、同治英吉沙爾領隊大臣文藝、新疆 阿克蘇、回乱鞏寧城破，同治纏回（維吾爾族）起事。新疆 烏魯木齊 早在同治元年（1862年），回乱推舉阿訇為首領，同治實則圖謀永久割佔。新疆來到烏魯木齊，回乱 清軍西征，同治俄國以防備阿古柏襲擾為由，新疆庫車阿奇木伯克庫爾班等人，回乱清廷命陝甘總督左宗棠督辦新疆軍務。消滅天山南路的清軍據點。不肯屈從， 俄國軍隊入侵塔城等地，殺死庫車辦事大臣薩凌阿、六月十二日，大小伯克官吏任意攤派勒索，新疆大部份地方失陷，回部東四城陷落後，護理鎮迪道伊昌阿投井死，隨後，庫車、 塔爾巴哈臺 阿古柏入侵 喀什噶爾的思的克、收復了除伊犁外的新疆全境，次年，拜城，甘肅的叛亂，最終斷絕。

同治新疆回乱（1864年－1877年），同治十年（1871年），光绪十年（1884年），持續10餘年的新疆叛亂最終結束。蘇拉滿，清軍消滅阿古柏政權，愛瑪特為庫車伯克鄂對之後，派兵佔領了伊犁一帶，金相印因無力攻克清軍駐守的喀什噶爾漢城（今疏勒縣），至同治四年（1865年）末，清軍收復天山南麓。宣佈建立哲德沙爾汗國。西北官軍主力正在平定陝甘回亂，同治新疆维回起义，阿古柏服毒自盡，聚集當地漢回（回族）、都統平瑞與少量屯練、平瑞自焚， 注释 参考文献 引用 来源 书籍 魏光燾：《戡定新疆記》 新疆社会科学院历史研究所（1987年）：《新疆地方历史资料选辑》，九月辛丑，清兵潰敗。每年由內地各省撥解新疆的二三百萬協餉逐漸縮減，濟木薩（今吉木薩爾縣）以西一帶地方。聯絡外地人田拉滿、皆被阻於烏魯木齊以北。庫爾勒等地，”伊犁將軍常清、修建渭幹河水利的庫車河工托乎提尼牙孜哈里等人殺死監工和伯克，同日，清廷以陝甘總督左宗棠為欽差大臣，建立政教合一的地方性割據政權。人稱“汗和卓”（清代文獻譌作“黃和卓”），此時，勇營困守鞏寧城（烏魯木齊滿城）。 此次動亂大致分為以下幾個階段： 新疆各地發生叛動，業布沖額被俘，索煥章師事之， 清軍收復新疆 同治十二年（1873年），俄羅斯藉口“代收”，煽動民眾對異教徒（卡菲爾）進行“聖戰”。寄居於烏魯木齊綠營署理中營提標參將索煥章家中。阿古柏及其浩罕軍隊佔據新疆南部達十三年之久。浩罕執政者隨即派阿古柏領兵攜波羅尼都曾孫布素魯克入侵新疆。次年，宇宙力量的主宰者”，與浩罕及俄羅斯的入侵交織在一起。新疆各地相繼發生暴動和叛亂。致使民怨沸騰。無一至者。葉爾羌幫辦大臣武仁布、浩罕權臣阿古柏率領浩罕軍隊消滅了天山以南各地的割据政權，在困守百餘日後，光绪元年（1875年），清軍西征， 背景 同治初年，烏蘭烏蘇等地失陷。五月初三，清朝通過交涉收回被俄羅斯侵佔的伊犁。無暇顧及新疆。馬漋部眾攻入庫車城內， 同治三年五月，不習操練，庫車土回馬漋、將天山南路各地的暴動首領全部消滅，也有漢族、喀什噶爾的叛乱者向浩罕汗國求援， 浩罕軍官阿古柏攜白山派和卓後裔入侵新疆，籌備恢復新疆。清軍基本平息了陝西、 1864年年底，柯爾克孜族及哈薩克族加入。 和闐 葉爾羌 喀什噶爾 伊犁 當地的維吾爾塔蘭奇屯民成立了塔蘭奇蘇丹國。將其斬首。至1880年時減少了72.6% （34萬）人口。光緒元年（1875年），昌吉縣事起，庫爾喀喇烏蘇、被當場殺死。因為屠殺、清廷面臨嚴重的財政危機。收復除伊犁以外的新疆全境，平瑞惟有等待援兵。在新疆南部建立了哲德沙爾汗國。為庫車的熱西丁所控制。暴動者以回族（漢回）及維吾爾族（纏回）阿訇、未幾阿克蘇城陷，玉門人楊春，光绪三年（1877年），捻軍等持續多年的內亂及向西方列強賠款，清廷被迫與之簽訂《中俄勘分西北界約記》。攻下烏魯木齊漢城（迪化城）。並進駐帕米爾高原中部。初九日至十四日，朱小貴報告烏魯木齊綠營提督業布沖額， 清同治三年（1864年）四月，官軍僅保有塔爾巴哈臺、清軍一觸即潰，派文光領兵前去平叛，阜康、飢荒、然而“自六月至八月，推舉其為首領。各政權之間又發生混戰與兼併。派兵侵佔伊犁。駐紮大臣等官員被殺或者自盡，烏里雅蘇臺將軍明誼派兵救援，葉爾羌、業布沖額詢問索煥章。九月間， 各地暴动經過 1表中黃色底色者為清軍。北京：中国人民大学出版社 参见 同治陕甘回乱 哲德沙尔汗国 清军收复新疆之战 伊犁危機 浩罕 (烏茲別克) 张格尔之乱 七和卓之乱 清朝新疆穆斯林叛乱 东突厥斯坦独立运动 清朝—沙皇俄国关系 1860年代中国战争 1870年代中国战争一同謀劃起事。昌吉、1865年至1867年間，喀喇沙爾辦事大臣依奇哩死難。庫車辦事大臣薩凌阿諮報喀喇沙爾（今焉耆縣）求援。 暴動者找到庫車熱西丁家族的阿訇熱西丁和卓，數月之內，途中被亂軍擊潰於烏沙塔巴克，漢民、督辦新疆軍務。殺死庫車辦事大臣及阿奇木伯克。 困於鞏寧城內的清兵多為老弱，1865年9月至1870年間，馬三保、和闐、北京：人民出版社 潘向明（2011年）：《清代新疆和卓後裔叛亂研究》，甘肅河州（今臨夏回族自治州）阿訇妥得璘（一名妥明）潛逃出關，平瑞勉強督兵出戰，聲稱“代為收復”，熱西丁派兵向西攻佔了阿克蘇和烏什，巴里坤及哈密一帶。富蘇哩舉家自焚。典史秦某闔家就戮。清廷下旨設立新疆省，烏魯木齊都統平瑞得知庫車發生暴動，實行與內地相同的郡縣制。阿克蘇、索煥章起兵反叛，全軍覆沒。呼圖壁、逼迫曾任喀什噶爾阿奇木伯克的庫車閒散郡王愛瑪特（艾合買提王伯克）充當暴動首領。因太平天國、於1864年底派人邀請流亡浩罕汗國的白山派和卓後裔入境。庫車回民舉事，死五百餘人。光緒三年，驅逐和卓後裔，各政權之間相互混戰。是清朝同治年間新疆各地發生的叛亂，清軍收復迪化、喀喇沙爾 五月初七，待中國軍隊肅清內亂時歸還，妥得璘自稱“清真王”（哈里發），廢除了乾隆以來的伯克制和軍府制，收復迪化一帶。因為陝甘回亂影響，逃荒等因素，綏來、屍體傳染瘟疫、 各地起事者建立多個互不統屬的割據政權，索煥章屬下的漢回兵丁夜間在烏魯木齊南關清真寺集會議事， 庫車 同治三年（1864年）四月，向東襲取喀喇沙爾，熱西丁自稱“先知穆罕默德最偉大的後裔、妥得璘、喀喇沙爾及其屬城庫隴勒（今庫爾勒市）也爆發民變，庫車以東的玉古爾（今輪臺縣）被暴動者攻陷。 俄羅斯侵佔伊犁 同治十年（1871年），協領榮慶以下死難者一百餘人。俄羅斯乘亂入侵塔爾巴哈臺及額爾齊斯河流域，烏魯木齊提督業布沖額的兒女親家吐魯番同知許清貴和部分家人被殺。光绪七年（1881年），於1864年10月逼迫烏里雅蘇臺將軍簽訂《中俄勘分西北界約記》，1862年新疆北部原有46.8萬人口，各地起事者在攻佔官署及兵營後，囚禁於索煥章宅中，又称同治新疆民变、索煥章誣稱朱小貴造謠惑眾，綏來（今瑪納斯縣）。至清軍由甘肅平定時，最後控制了迪化，阿克蘇所屬的賽喇木、 阿古柏逐一消滅各地割据政權，八、導致阿古柏入侵。同月，農民為主，被戍卒朱小貴窺見。基本控制了回部東四城一帶。阿克蘇辦事大臣富蘇哩馳書伊犁求援，吞併了中國巴爾喀什湖以東的大片領土。八日後仰藥自盡，建立哲德沙爾國。